Dalam pelaksanaan Pendidikan Profesi Dokter Spesialis Ilmu Bedah Subspesialis maka disusun struktur kurikulum dan beban studi sebagai acuan dalam pelaksanaan Program studi. Ruang lingkup struktur kurikulum disusun berdasarkan Standar Profesi Dokter Spesialis Ilmu Bedah Subspesialis yang mencakup standar profesi medik berupa pengetahuan dan keterampilan Ilmu Bedah yang bersifat holistik, tatalaksana kedaruratan, dan bidang area serta kompetensi yang harus dikuasai.
Model kurikulum yang akan digunakan adalah model kurikulum kompetensi melalui pendekatan sistem model kurikulum Beauchamp. Stuktur, peta, dan durasi mengikut kurikulum pada standar pendidikan profesi bedah subspesialis bedah digestif. Isi garis besar struktur kurikulum disajikabentuk rencana pembelajaran studi sesuai dengan format RPS dari Dikti. Pada setiap tindakan juga memiliki modul yang dapat menjadi pedoman peserta didik. Tahapan pendidikan dimulai dari orientasi, latihan, kemudian umpan balik. Tingkat kewenangan dalam mengerjakan prosedur keterampilan klinis diatur dalam 5 tahap supervisi terkait dengan risiko dari masing-masing prosedur. Kewenangan ini terkait dengan kompetensi atau level kemampuan yang diharapkan pada masing-masing tahap. Kurikulum Program Studi Ilmu Bedah Subspesialis Bedah Digestif FK UH dapat dilihat pada tabel dibawah.
Kurikulum Program Studi Ilmu Bedah Subspesialis Bedah Digestif FK UH
| Mata Kuliah | DOSEN PENGAMPU | SKS |
| SEMESTER 1 | ||
| Filsafat Ilmu, Humaniora dan Sejarah Perkembangan Ilmu | FK UH | 2 |
| Metode Penelitian | FK UH | 1 |
| Biostatistik dan Komputer Statistik | FK UH | 1 |
| Biologi Molekuler | FK UH | 1 |
| Imunologi | FK UH | 1 |
| Farmakologi Klinik | FK UH | 1 |
| Bedah Minimal Invasif | dr. Julianus Aboyaman Uwuratuw, Sp.B, Susp.BD(K) | 1 |
| Kedokteran Berbasis Bukti | Dr. dr. Ibrahim Labeda, Sp.B, Subsp.BD(K) | 1 |
| Sepsis | dr. Erwin Syarifuddin, Sp.B, Subsp.BD(K) | 1 |
| Cairan dan Nutrisi | Dr. dr. Ronald Erasio Lusikooy, Sp.B, Subsp.BD(K) | 1 |
| Perioperative Care | dr. Samuel Sampetoding, Sp.B, Subsp.BD(K) | 1 |
| Kemoterapi dan Radioterapi | dr. M. Ihwan Kusuma, Sp.B, Subsp.BD(K) | 1 |
| Instrumentasi Modern Pembedahan | dr. Julianus Aboyaman Uwuratuw, Sp.B, Susp.BD(K) | 1 |
| Anatomi Sistem Digestif | dr. Erwin Syarifuddin, Sp.B, Subsp.BD(K) | 1 |
| Fisiologi Sistem Digestif | Dr. dr. Ibrahim Labeda, Sp.B, Subsp.BD(K) | 1 |
| Prinsip Operasi Bedah Digestif | dr. Erwin Syarifuddin, Sp.B, Subsp.BD(K) | 1 |
| Dasar Transplantasi dalam Bedah Digestif | dr. Julianus Aboyaman Uwuratuw, Sp.B, Susp.BD(K) | 1 |
| Tindakan Diagnostik dan Operatif Bedah Digestif 1 | Dr. dr. Ibrahim Labeda, Sp.B, Subsp.BD(K) | 2 |
| SEMESTER 2 | ||
| Trauma Abdomen | dr. M. Ihwan Kusuma, Sp.B, Subsp.BD(K) | 3 |
| Tindakan Diagnostik dan Operatif Bedah Digestif 2 | dr. Murny Abdul Rauf, Sp.B, Subsp.BD(K) | 7 |
| Proposal Penelitian | Dr. dr. Ronald Erasio Lusikooy, Sp.B, Subsp.BD(K) | 2 |
| Penulisan Karya Tulis Ilmiah 1 | Dr. dr. Ibrahim Labeda, Sp.B, Subsp.BD(K) | 1 |
| Kemampuan Mendidik 1 | dr. Erwin Syarifuddin, Sp.B, Subsp.BD(K) | 1 |
| SEMESTER 3 | ||
| Bedah Esofagus | dr. M. Ihwan Kusuma, Sp.B, Subsp.BD(K) | 1 |
| Bedah Gaster dan Duodenum | Dr. dr. Ronald Erasio Lusikooy, Sp.B, Subsp.BD(K) | 1 |
| Bedah Hati dan Sistem Empedu | dr. Julianus Aboyaman Uwuratuw, Sp.B, Susp.BD(K) | 1 |
| Bedah Pankreas | Dr. dr. Ibrahim Labeda, Sp.B, Subsp.BD(K) | 1 |
| Tindakan Diagnostik dan Operatif Bedah Digestif 2 | dr. Mappincara, Sp.B, Subsp.BD(K) | 7 |
| Pelaksanaan Penelitian | dr. Erwin Syarifuddin, Sp.B, Subsp.BD(K) | 1 |
| Penulisan Karya Tulis Ilmiah 2 | dr. Julianus Aboyaman Uwuratuw, Sp.B, Susp.BD(K) | 2 |
| Kemampuan Mendidik 2 | Dr. dr. Ronald Erasio Lusikooy, Sp.B, Subsp.BD(K) | 1 |
| SEMESTER 4 | ||
| Bedah Usus Halus dan Dinding Abdomen | Dr. dr. Ibrahim Labeda, Sp.B, Subsp.BD(K) | 1 |
| Bedah Usus Besar | Dr. dr. Ronald Erasio Lusikooy, Sp.B, Subsp.BD(K) | 1 |
| Bedah Anus dan Perianal | Dr. dr. Warsinggih, Sp.B, Subsp.BD(K), M.Kes. | 1 |
| Manajemen Komprehensif pada Kanker Kolorektal dengan Metastasis | dr. Erwin Syarifuddin, Sp.B, Subsp.BD(K) | 4 |
| Tindakan Diagnostik dan Operatif Bedah Digestif 3 | dr. Samuel Sampetoding, Sp.B, Subsp.BD(K) | 5 |
| Kemampuan Mendidik 3 | dr. M. Ihwan Kusuma, Sp.B, Subsp.BD(K) | 1 |
| Karya Ilmiah Akhir | Dr. dr. Warsinggih, Sp.B, Subsp.BD(K) | 6 |
| TOTAL SKS | 68 | |